يقع المقر الرئيسي لقيادة قوة أمن المنشآت بمنطقة المدينة المنورة في المدينة المنورة وتشمل ما يلي:
قوة أمن المنشآت بمحافظة ينبع.
قوة أمن المنشآت بمحافظة المسيجيد.